Технология точного редактирования генома PE7 и PE6 впервые применена у пациентов. Двум больным с хронической гранулематозной болезнью (ХГБ) ex vivo исправили мутацию в гене NCF1 в стволовых клетках крови. Доля функциональных нейтрофилов у одного из пациентов достигла 83%, эффект сохранялся до шести месяцев наблюдения без серьёзных побочных реакций.
Семь лет назад гарвардские исследователи представили метод праймированного редактирования (prime editing). По их оценкам, технология способна корректировать почти 89% врождённых мутаций человека. В 2025 году подход впервые применили в клинике — результаты опубликованы в New England Journal of Medicine.
В отличие от классического CRISPR-Cas9, режущего обе нити ДНК и часто приводящего к случайным вставкам или делециям, праймированное редактирование действует аккуратнее. Инженеры использовали мутантную версию Cas9, разрезающую только одну цепь. К ней присоединили обратную транскриптазу. Гибридная молекула pegRNA одновременно наводит инструмент на цель и несёт черновик нужной правки. Cas9 делает надрез, освободившийся конец ДНК спаривается с pegRNA, а обратная транскриптаза дописывает новый фрагмент прямо в разрыв. Получается своего рода «текстовый редактор» генома.
На пути в клинику инженерам пришлось решить несколько проблем.
Первая — низкая эффективность. Клеточные нуклеазы быстро разрушали «хвост» pegRNA. Защитный псевдоузел (epegRNA) и белок La, предохраняющий РНК от деградации, дали жизнь системе PE7.
Вторая — крупный размер компонентов. Методом непрерывной эволюции на фагах (PACE) отобрали компактные и активные варианты обратной транскриптазы. Версии PE6a и PE6b заметно меньше оригинала, что упрощает их упаковку в вирусные векторы.
Третья — система репарации неспаренных оснований (MMR). Этот клеточный «контролёр качества» распознаёт несовпадения ДНК, возникающие при редактировании, и отменяет правку. Подавление MMR с помощью доминантно-негативного белка MLH1 повысило эффективность.
Четвёртая — расширение возможностей. Исходная версия заменяла 1-3 генетические «буквы». Двойные pegRNA (две направляющие вместо одной) позволили вырезать фрагменты ДНК размером до десяти тысяч пар оснований (PRIME-Del) или вставлять целые гены.
Пятая и самая сложная — доставка. Стандартные аденоассоциированные вирусы (AAV) вмещают не более 4,7 тыс. пар оснований. Для полноразмерной системы нужно около 6,3 тыс. Решение — разрезать белок на две половинки, каждую упаковать в отдельный вирус, а потом сшить внутри клетки. Такой подход использовали в экспериментах на грызунах с наследственной тирозинемией и врождённой слепотой. Альтернатива — липидные наночастицы (LNP), известные по мРНК-вакцинам. В печени мыши с их помощью добились 8% правки гена Pcsk9 (мишень для снижения холестерина). Однако LNP естественно накапливаются в печени. Для мышц или мозга нужны другие подходы, например, вирусоподобные частицы (eVLPs). В 2024 году eVLP доставили комплекс праймированного редактирования в сетчатку мыши, исправив мутацию слепоты с эффективностью около 15%.
Самый надёжный способ на сегодня — ex vivo. Забрать клетки пациента, отредактировать в пробирке, вернуть обратно. Именно так метод впервые применили у людей.
В испытание включили двух пациентов с хронической гранулематозной болезнью (ХГБ) — редким наследственным иммунодефицитом. Мутация delGT в гене NCF1 лишала их нейтрофилы способности убивать бактерии. Врачи взяли у больных стволовые клетки крови (HSPC), отредактировали их ex vivo с помощью праймированного редактирования, а после лёгкого курса химиотерапии (чтобы освободить место в костном мозге) вернули обратно.
Доля исправленных клеток в инфузионном продукте составила 13–23% (по GTGT-аллелям). У второго пациента через месяц 83% нейтрофилов вновь производили активные формы кислорода. Функция сохранялась через четыре и шесть месяцев наблюдения. Серьёзных побочных эффектов, связанных с самой технологией редактирования, не зафиксировали.
Технически праймированное редактирование способно нацелиться на большинство точечных мутаций — обещанные 89% остаются достижимы. Однако «текстовый редактор» генома оказался капризным в доставке и эффективности. Тем не менее, технология уже вошла в клинику. Следующие испытания готовятся для серповидноклеточной анемии, метахроматической лейкодистрофии и муковисцидоза.
Праймированное редактирование ДНК прошло клинические испытания на людях
Комментарии (0)