Был проведен систематический обзор и метаанализ для определения взаимосвязи присутствия цитотоксин-ассоциированного гена А (cagA) и гена вакуолизирующего цитотоксина A (vacA) с устойчивостью к антибиотикам изолятов Helicobacter pylori (H. pylori).

Для выявления релевантных работ был проведен поиск в таких электронных базах данных, как Google Scholar, DOAJ, EMBASE, Scopus, PubMed и Clarivate. Для оценки качества включенных в анализ исследований была использована шкала Университетов Ньюкасла и Оттавы (Newcastle-Ottawa Scale, NOS). Для проведения статистического анализа извлеченных работ была использована компьютерная программа Comprehensive Meta-Analysis, версия 2.2.

Для определения возможной корреляции между присутствием генов cagA и vacA и устойчивостью к кларитромицину, левофлоксацину, амоксициллину, метронидазолу и тетрациклину использовали отношение шансов и 95 % доверительный интервал. В качестве дополнительной меры по устранению влияния неоднородности на общие результаты был выполнен анализ чувствительности и анализ методом метарегрессии. Для определения того, присутствует ли во включенных в анализ работах систематическая ошибка, связанная с предпочтительной публикацией положительных результатов исследования, и насколько сильно она влияет на результаты, был проведен анализ методом trim and fill, а также оценка с помощью воронкообразного графика, теста Эггера и теста Бегга.

Было выявлено наличие сильной корреляции между cagA-статусом патогена и повышением устойчивости к метронидазолу (отношение шансов (OR): 2,69). Под воздействием cagA-положительных штаммов у населения западных стран может усиливаться устойчивость к левофлоксацину (OR: 11,33), амоксициллину (OR: 19,68) и метронидазолу (OR: 1,59). После обработки данных с использованием метода trim and fill скорректированное OR существенно не отличалось от исходных значений. Это указывает на то, что результаты оценки в подгруппах были статистически значимыми. Напротив, присутствие штаммов с геном vacA часто приводило к снижению устойчивости этого патогена к антибиотикам, причем при генотипе vacA s1m1 происходило статистически значимое снижение устойчивости к метронидазолу (OR: 0,41).

Устойчивость к антибиотикам штаммов с генотипом vacA s2m2 была минимальной. Это может быть связано с отсутствием способности у таких штаммов вызвать воспаление. Влияние неоднородности на общие результаты было в удовлетворительной степени устранено путем проведения анализа чувствительности и анализа методом метарегрессии. Несмотря на то, что после обработки объединенных данных методом trim and fill значение OR стало ниже, итоговые результаты, касающиеся взаимосвязи между наличием гена vacA и устойчивостью к антибиотикам, остались без изменений.

У изолятов, в которых присутствуют cagA-положительные штаммы, имеется устойчивость к метронидазолу. При наличии генотипа VacA s1m1 у патогена повышается устойчивость к амоксициллину и левофлоксацину. При этом при наличии генотипа vacA s1m2 устойчивость к кларитромицину и метронидазолу снижается, тогда как при наличии генотипа vacA s1m1 устойчивость к метронидазолу резко повышается. У менее вирулентных штаммов (с генотипом vacA s2m2) устойчивость к антибиотикам была статистически значимо ниже по сравнению с другими штаммами.